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Komplettsystem fuer Matlab/Mikroskopie gesucht

wacht 29.04.2016 - 17:38 1498 9
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wacht

pewpew
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Ich bin beauftragt einen ordentlich Rechner zusammenzustellen, aber abseits vom 0815-Gaming Sys kenn ich mich eher beschraenkt aus ;)

Einsatzzweck: Mikroskopie mit der Software von Olympus (CellSens), anschliessend Bildanalyse in Matlab. Fuer CellSens reicht jeder StandardGamer (ohne GPU), Matlab braucht allerdings ordentlich CPU/Speicher denke ich, je nachdem wie es dann ausgefuehrt werd gibts entweder ein paar hundert 50MB Bilder oder ein grosses 30GB das abgearbeitet werden muss. Ob/wie Komprimierung da anwendbar ist muss erst getestet werden deshalb mal soviel Power wie es im Budget (2000eu) gibt.

Bildschirm (nochmal 1000eu) fuer die manuella Bildanalyse wird auch gesucht - 30-35", 4k, IPS, matt, gute Kontraste und 'stabile' Farben. Ob die Farben jetzt 'falsch' sind ist egal, solange sie immer gleich falsch sind :D
Getestet wurde hier bereits ein iiyama der ganz passabel aber imo zu glossy und den Kollegen 'zu gross' war...

Mein erster Ansatz: .
5820K + Asrock Extreme4 X99 + (vorerst) 64GB DDR4 + 950 pro
Dazu noch 4TB irgendeine HDD und irgendeine GPU fuer DP
Bearbeitet von wacht am 29.04.2016, 17:40

smashIt

master of disaster
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vorsicht!
cellsens wird dort wahrscheinlich in verbindung mit einer olympus kamera verwendet
die dinger gibts je nach modell und alter mit allen möglichen anschlüssen
da kann dir von usb bis spezieller pci-karte alles unterkommen
Bearbeitet von smashIt am 29.04.2016, 18:00

wacht

pewpew
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Guter Punkt - iirc wars USB3 bzw hab ich jetzt mal angnommen das eine evtl. Erweiterungskarte dabei und sowieso PCIe waer, s genaue Modell hab ich nimma im Kopf - werd am Montag nochmal s Angebot anschaun...

smashIt

master of disaster
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lalaker

TBS forever
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http://geizhals.at/?cat=WL-666048

Ich denke bei der Graka kann man sicher noch sparen ;)

Auch beim RAM würden 2400er mit gleichen Latenzen rund 100 Euro weniger kosten. Ob da eine höhere Taktfrequenz gerechtfertigt ist, weiß ich nicht.
Bearbeitet von lalaker am 29.04.2016, 19:17

smashIt

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hat dein kunde eigentlich ansprüch bezüglich matlab und cuda?

wacht

pewpew
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Ich bin quasi der Kunde (Uni) ;)
Noch nicht klar, kommt wohl draufan wie notwendig/aufwaendig das is, bzw ob diese Automatisierung ueberhaupt sinnvoll funktioniert und den erhofften Vorteil bringt oder ob es weiterhin manuell passieren muss. Bisher lagen die groesseren Probleme in der nicht wirklich dafuer geeigneten Optik (Bastelloesung). Ob das was wird haengt hauptsaechlich von der Erkennungsrate und dem Durchsatz an gescannten Proben ab und das ist momentan einfach noch net abschaetzbar.
Das Komplettsystem vom Hersteller ist zu dem Preis zwar von der CPU her halbwegs auf Augenhoehe (?), dafuer gibts nur 8GB RAM und kleine Sys-SSD - reicht ja auch fuer CellSens.
Budget ist aber jetzt zum Mikroskop-Kauf da und nachher wohl eher nicht mehr. Under-Budget sein bringt genau garnix, es gilt also das Geld moeglichst sinnvoll zu investieren. Wenn Matlab nix wird dann kann er unseren Haupt-Comsol-Rechner etwas entlasten wenn ihm fad ist ;)

// ob bei Comsol Cuda gefragt ist weis ich auch net, war fuer mein Gebiet bisher net relevant..
Bearbeitet von wacht am 29.04.2016, 21:59

Hansmaulwurf

u wot m8?
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Zitat von wacht
// ob bei Comsol Cuda gefragt ist weis ich auch net, war fuer mein Gebiet bisher net relevant..
1) RAM sollte reichen, MATLAB hat furchtbares Memory-Managment imho, ich kenn das von 1 GB Images, die dann 3 GB im Speicher brauchen. Drunter würd ich nicht gehen.
2) Gerade bei Bild-Bearbeitungssachen kann die eine CUDA-Karte viel Ersparniss bringen, also zeitlich. 32 GB-Datensätze kriegst halt schwer rein (in den GPU-Speicher), kommt aber auf das Anwendungsgebiet an und ob es vernünftige funktionen schon gibt. Grundvorraussetzung ist iirc die Parallels-Toolbox, ich kann aber noch nachschauen welche TB das war.

wacht

pewpew
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Soo.. Matlab wird wohl anders geloest werden, bleiben also nur noch ein paar kleine Fragen.

Machts einen Unterschied ob 4x16 oder 8x8GB RAM? Quad Channel geht mit 4x16 auch und waer fuer Erweiterbarkeit am sinnvollsten? Bzw - kann ich ueberhaupt auf 128GB upgraden mit der CPU? Offiziell kanns ja nur 64GB, Internet ist sich net einig drueber...

Diese Gschichte mit booten von M2 SSDs is e kein Problem mehr? (Win7 waers)

lalaker

TBS forever
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Sämtliche 2011-3 CPUs machen bei 64 GB offiziell Schluss. Vlt. ändert sich da was mit Broadwell-E.

M2 und Win 7 ist kein Problem, haben ein paar Leute hier im Forum schon gemacht, die können bei Problemen sicher weiter helfen.

Preislich sind 8x8 GB sicherlich günstiger, ich bin aber immer für weniger Module und die Möglickeit zu erweitern, auch wenn es im Moment sinnlos erscheint.
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